14年(nián )前，初号机疑似神化第一形态的觉醒带来近三冲击，使世界发生前所未(wèi )有的巨变。在此之后，葛城美(měi )里（三石琴乃 配音）等NERV旧(jiù )部出走，成立了反抗seele和NERV的Wille。Wille授命明日香（宫村优子 配音）和真里（坂本真绫 配音）夺回被封印在卫星轨道上的初号机和碇真嗣（绪方惠美 配音），但绝对禁止真(zhēn )嗣登上初号机(jī )。感受到周遭的敌意，懵懂的真嗣跟随绫波丽（林原惠美 配音）登上突然入侵的(de )九号机，返回了千疮百孔的NERV总部。在这(zhè )里，他意外重逢朝思夜想(xiǎng )的(de )绫波，还从(cóng )父亲那里得知自己将和美少年渚薰（石田彰 配音）共同驾驶十三号机。长达14年的空白，期间的沧桑巨变和情感纠葛让真嗣不知所措。而看似温柔的渚薰为他揭开了种种(zhǒng )难以置信的真(zhēn )相……　　本片为EVA新剧场版四部曲的第三(sān )部。